细菌的直接感染
食物受到细菌污染。在没有被充分加热熟透的情况下，致病细菌可以直接进入胃肠道，大量繁殖，侵袭胃肠黏膜，造成消化道症状。
细菌或真菌毒素中毒
有一些细菌或真菌在食物上繁殖的时候，不仅造成食物变质，同时还会产生大量毒素。这些毒素有的耐热能力很强，不像细菌那样通过一般加热容易消灭，所以可以造成中毒症状。
食物中含有有毒物质
食物中可能含有瘦肉精、亚硝酸盐、工业用盐、化肥、农药、鼠药等各种有毒化学物质。有些食物也可能含有天然有毒物质而没有被加工去除干净，比如河豚、生鱼胆、毒蘑菇、苦杏仁、生扁豆、发芽土豆等。
过敏
这一点是很多人可能想不到的。过敏不一定都表现为皮肤起疹，瘙痒。胃肠道也会出现“过敏”，其症状就是以腹痛、腹泻为主。平时吃得比较少的食物，引起过敏的几率更高，比如海鲜，螃蟹等水产品。
